改革开放以来,祁东县卫生事业得到了长足发展,取得了辉煌的成就。1990-2004年,全县投入县级及乡镇医院房屋建设资金1986万元,新、改、扩建项目76个,面积10.3万平方米。投入设备购置资金1820万元,购置仪器设备422台件。县人民医院、县中医医院均达到国家“二级甲等”医院标准,有8所乡镇医院先后达到“一级甲等”医院标准。计划免疫以乡(镇)为单位达到85%,于1995年经省、市考核提前达标。学校卫生工作在全国20个试点县中荣获第二名。妇幼保健工作自1992年以来接连被省或市评为先进单位。县直4所医院于1996年经省市评审达到“爱婴医院”标准。农村改水连续4年被省、市评为先进单位。全县累计享有卫生厕所人口总数30.14万人,占全县人口的33.1%。1996年10月,该县农村初级卫生保健工作经省级评审达到国家初级卫生保健合格县标准,2000年经省卫生厅验收评定达到农村中医“合格县”。卫生工作2012、2013年连续两年在全市卫生工作目标管理考核中荣获先进,计生工作2012年实现“摘帽进位”,2013年进入全省先进行列,2004年祁东卫生工作目标管理考核荣获全市第一名,2015年县计生协会获评全省模范计生协会。
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